金山区位于长江三角洲南翼，西南部。东邻奉贤区，西与浙江省平湖市、嘉善县交界，南濒杭州湾，北与松江区、青浦区接壤。 　　金山6400年前已成陆，全境地势低平，地面高程自北西至东南略有升高，西临杭嘉湖浙水下游，受浙江客水和黄浦江潮水之利，河渠交织成网。区内有地区仅存的古海岸遗址漕泾古冈身沙冈，戚家墩、查山、亭林、招贤浜、南阳港等古文化遗址。有23.3公里“黄金”海岸线。距陆地东南6.2公里海面上有大金山、小金山、浮山三岛，大金山海拔103.4米（吴淞高程），是市地面最高点，山上生长着地区陆上早已绝迹的原始植被和珍稀植物，是区境内正待开发的重要旅游资源之一。金山三岛至陆地为广阔的深水区，是一个天然良港。